Apikotomija zoba je manjši kirurški poseg, s katerim se odstrani vrh zobne korenine (apeks), najpogosteje zaradi kroničnih vnetij na vrhu korenine (granulom ali cista).
S posegom se odstrani vrh korenine skupaj z vnetnim tkivom, koreninski kanal pa se nato zapolni s posebnimi mešanicami in materiali, ki so za to predvideni, bodisi med posegom bodisi že pred njim.
V določenih primerih je pred samim posegom potrebno ponovno
zdraviti zob, torej opraviti endodontsko terapijo (čiščenje in širjenje kanalov ter njihovo polnjenje).
Apikotomija postaja vse pogostejši poseg, saj pacientom omogoča ohranitev zoba, ki ga ni mogoče pozdraviti samo z odstranitvijo živca in bi ga bilo sicer treba izpuliti.
Vendar pa zoba v določenih primerih ni mogoče rešiti niti z apikotomijo - na primer pri večkoreninskih zobeh ali zobeh v spodnji čeljusti, zlasti v stranskih in zadnjih predelih.